Servicio de Análisis Biológicos
Unidad de Ecología Microbiana
En la Unidad de Ecología Microbiana del laboratorio de IMDEA Agua, proporcionamos un servicio integral de análisis microbiológico, que abarca tanto métodos clásicos como moleculares, destinado a evaluar la calidad de aguas superficiales, subterráneas y matrices afines. Ofrecemos este servicio no solo a investigadores de IMDEA, sino también a centros de investigación, empresas y organismos oficiales. Nuestros análisis se llevan a cabo de acuerdo con métodos normalizados nacionales e internacionales, cumpliendo con los estándares establecidos en las Normas UNE-EN ISO relativos a análisis de la calidad microbiológica del agua.
Ofrecemos
Análisis moleculares en agua y matrices afines:
- Extracción y cuantificación de ADN y ARN.
- Secuenciación de ADN y ARN con la tecnología de nanoporos para estudios de biodiversidad bacteriana y metagenómica
- Detección y cuantificación de genes específicos de relevancia ambiental, como aquellos relacionados con el ciclo del nitrógeno, resistencia a antibióticos y producción de microcistinas
Análisis de un gran conjunto de indicadores biológicos de calidad del agua:
- Escherichia coli y coliformes totales
- Enterococos intestinales
- Clostridium perfringens
- Pseudomonas aeruginosa
- Bacterias aerobias totales a 22ºC y 37ºC
- Cryptosporidium y Giardia
- Campylobacter sp
Otros análisis microbiológicos para caracterización del agua:
- Antibiograma de enterobacterias aerobias
- Identificación y cuantificación de cianobacterias en agua
- Extracción y cuantificación de microcistinas por cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas (LC-MS).
Análisis de actividad enzimática para el control de calidad de suelos y fangos:
- Fosfatasa
- Arilsulfatasa
- β-Galactosidasa
- Ureasa
- Secuenciadores MinION (Nanopore) MK1C y MK1
- PCR en tiempo real Lightcycler 96 (Roche) y AB7300 (Thermo)
- Nanofotómetro (Biotek) y fluorímetro Qubit4 (Invitrogen)
- Sistema de documentación de geles GelDoc Go Imaging System de Bio-Rad
- Termocicladores SimpliAmp y TC-5000 (Applied Biosystems y Techne)
- Equipo de electroforesis en gel (Biorad)
- Homogeneizador para la extracción de ADN (Precellys)
- Microscopio de luz, Olympus CX41
- Cámara de fotos digital, Olympus
- Evaporador giratorio con sistema de refrigeración Buchi para la extracción de cianotoxinas
- Equipos de extracción en fase sólida, para concentrar extractos de toxinas
- Incubadora para cultivos de cianobacterias y bacterias
Secuenciadores Minion MK1C y MK1
Nanofotómetro Epoch y Fluorómetro Quibit 4
PCR en tiempo real Lightcycler 96
Incubadora para cultivos de cianobacterias y bacterias
Sistema de documentacion de geles GelDoc Go Imaging System
Personal del servicio
- 1 Responsable del servicio: Dra. Iame Alves Guedes, Encargada de la organización, supervisión de personal y coordinación de proyectos.
- 2 Técnicas de Laboratorio: Ana Isabel Morato Cerro, responsable de la identificación y cuantificación de indicadores microbiológicos relacionados con la calidad del agua y del suelo, y Sofía Viudez Perdices, encargada del procesamiento de muestras para secuenciación mediante tecnología Oxford Nanopore Technologies (ONT) y de la cuantificación de genes mediante PCR.
- 2 Técnicas Superiores: Silvia Sánchez González, encargada de los análisis bioinformáticos y procesado de datos de la Unidad de Ecología Microbiana, y Paula Martín González, encargada del análisis de bacterias y genes de resistencia a antibióticos, así como del procesamiento de datos, la validación de resultados y el desarrollo de nuevas metodologías.
